145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0194 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  48.26 
 
 		 261 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  47.51 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  45.17 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  42.08 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  42.47 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  41.22 
 
 		 264 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.08 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25.33 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  29.36 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.1 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  31.25 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  27.19 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  19.67 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  22.91 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.04 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  22.43 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.49 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  27.92 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  25.84 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  20.24 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  25.1 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  26.22 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  27.18 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  23.93 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  21.64 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  23.11 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  21.07 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.75 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  24.24 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  25.25 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  23.29 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  27.06 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  24.03 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.34 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  23.28 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  24.59 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  22.18 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  23.12 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  22.44 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3059  DNA repair protein RecO  24.7 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  22.67 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  29.2 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  24.21 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  23.9 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  23.78 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  23.4 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>