177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1411 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  33.2 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  32.38 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  28.31 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  28.31 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  25.11 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27.98 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  28.09 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.23 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  27.66 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.57 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  26.34 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  22.95 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  27.73 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  31.49 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  23.65 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.73 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  27.68 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  27.68 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.94 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  22.98 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  21.07 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  19.92 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  23.26 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  27.48 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  24.55 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  20.32 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  20.24 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  24.86 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  21.01 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  24.23 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  18.85 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  23.76 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  22.97 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  24.06 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  19.83 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  27.27 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  25.95 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  21.93 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  21.93 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  21.93 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  21.25 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  17.55 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  24.18 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  27.5 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  22.16 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  20.09 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.26 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  21.23 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  21.66 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  20.16 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  20.66 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  24.62 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  22.65 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  24.55 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  27.32 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  33.76 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  20.32 
 
 		 284 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  18.29 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  22.16 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  20.32 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  24.87 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  23.76 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  23.15 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  20.53 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  19.42 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  25.42 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  26.03 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  20.63 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  27.95 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  27.95 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  19.91 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  19.91 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  27.95 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>