158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2271 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  30.88 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.78 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  30.5 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.81 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  27.68 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.11 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  26.73 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.5 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 271 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.62 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  28.31 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  31.01 
 
 		 257 aa  84.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.4 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.91 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  26.34 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  25.88 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  25.44 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  34.64 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  27.11 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  25.14 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  23.32 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  29.26 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  21.28 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  27.83 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  29.66 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  32.82 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  25 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  23.16 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  25.57 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  21.02 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  23.35 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  23.57 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  22.67 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  23.64 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  29.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  23.57 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  27.78 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  28.89 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  20 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.75 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  30.16 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  28.85 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  22.29 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  26.21 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.94 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  27.97 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  22.36 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.88 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  21.6 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.15 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.15 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.15 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  20 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>