83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0046 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  64.82 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  55.6 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  39.68 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  32.26 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  32.79 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  31.58 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  26.97 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  31.8 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.21 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  22.45 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.5 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  21.14 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  21.4 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  21.4 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  30.68 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.14 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  23.77 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  23.01 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  23.11 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  25.48 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.09 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  24.42 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  23.79 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  20.72 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  21.22 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  24.6 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  17.81 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.21 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  23.65 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  19.49 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  26.15 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  25.23 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  21.09 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  29.31 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  25.65 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  24.59 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  25.64 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  19.75 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  26.49 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  22.29 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  22.63 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  21.48 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  25.17 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  25.83 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  22.09 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  21.91 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  30.68 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  35.19 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  24.34 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  20.57 
 
 		 262 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 		 262 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>