80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0990 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  49.59 
 
 		 259 aa  255  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  36.59 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 248 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  32.4 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  30.4 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  29.75 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  28.57 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  24.08 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.14 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  30.8 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  21.72 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.69 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.15 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.16 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  23.15 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  24.32 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  21.67 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.65 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.65 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  21.54 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  25.9 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  21.46 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25.68 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  22.97 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  26.62 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  22.83 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  27.34 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.62 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  21.59 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  22.3 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  19.58 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  21.05 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  24.29 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  21.66 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  24.82 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  25.62 
 
 		 238 aa  42  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>