91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl267 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  32.22 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  26.52 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  22.68 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  24.23 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  27.17 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  26.14 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  24.72 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  23.16 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  24.04 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  24.72 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.85 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  23.16 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  24.72 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  25.56 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  22.1 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  22.16 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  21.54 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  22.6 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  20.33 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  20.56 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  23.91 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  20.63 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  23.16 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  25.13 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  19.62 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.68 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  25.27 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  22.41 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  20.85 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  23.37 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  21.79 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  21.32 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  20.88 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  23.24 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  25 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  26.18 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  20.39 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  22.83 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  21.91 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  22.35 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  23.3 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  20.56 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  21.93 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  22.65 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0563  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.282458  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  24.63 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.88 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  20 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  20.37 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  22.28 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  22.1 
 
 
251 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  20.19 
 
 
273 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  21.14 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  24.87 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  24.14 
 
 
255 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  23.39 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  21.81 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  22.76 
 
 
302 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  21.74 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  22.91 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  20.77 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  20.92 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  21.47 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  29.56 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  20.88 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 
288 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  19.23 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  23.72 
 
 
283 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 
243 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>