171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0597 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 
244 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  33.2 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  35.08 
 
 
243 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  40.13 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  39.47 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  31.98 
 
 
209 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  35.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  32.42 
 
 
254 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  32.42 
 
 
254 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  38.38 
 
 
254 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.4 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  37.22 
 
 
248 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  36.11 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  31.71 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  29.18 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  36.14 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  34.46 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 
249 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  29.83 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  30.61 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  28.4 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  30.28 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  30.05 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  35.2 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  26.94 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.5 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  30.45 
 
 
265 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  35.2 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  35.2 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  35.2 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  30.81 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  27.31 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  31.35 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  30.23 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  35.68 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  35.36 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  25.88 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  29.65 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  33.7 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  34.59 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  31.67 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  34.24 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 
243 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  34.81 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  32.96 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  28.9 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  34.41 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  27.17 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  32.4 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  31.84 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.2 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  33.33 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2462  DNA repair protein RecO  34.46 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  29.44 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  34.24 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  28.19 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  26.27 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  31.72 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  33.51 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  30.94 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  31.76 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  24.08 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  26.36 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1688  DNA repair protein RecO  31.15 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0524838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  24.82 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  31.85 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0317  Recombination protein O RecO  30.34 
 
 
178 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.44578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 
288 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  24.81 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  28.04 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>