21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2035 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2035  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000013489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1264  DNA repair protein RecO  57.37 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0289  Recombination protein O RecO  55.25 
 
 		 506 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.236131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  44 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  42.91 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1688  DNA repair protein RecO  42.23 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0524838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  23.58 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  23.21 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.4 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  20.66 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  29.37 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.74 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  21.95 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  21.94 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.56 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  26.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>