84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0855 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0855  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0701  Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  37.5 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1721  DNA repair protein RecO  35.81 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  33.91 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  32.37 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  33.7 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  36.31 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  31.79 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  34.68 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  30.95 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  30.96 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  31.32 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  33.53 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  29.48 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  30.85 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  29.48 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  31.41 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  31.21 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  28.41 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  27.53 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  31.53 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24.34 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  31.43 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  30.37 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  31.55 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  32.28 
 
 		 279 aa  52  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  31.64 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  33.12 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  33.75 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.54 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.89 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27.55 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  29.44 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.45 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  30.21 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  25.27 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  28 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  29.27 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.72 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  24.59 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  25.57 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  24.05 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.65 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  31.15 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  31.11 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  31.07 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24.56 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  26.63 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  25.71 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 244 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  23.5 
 
 		 250 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>