More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2280 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  96.51 
 
 
461 aa  896    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  96.3 
 
 
461 aa  896    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  95.21 
 
 
459 aa  883    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  96.3 
 
 
461 aa  896    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  96.08 
 
 
461 aa  893    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.02 
 
 
461 aa  816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  96.51 
 
 
459 aa  894    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  97.6 
 
 
477 aa  899    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  96.3 
 
 
461 aa  896    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  96.3 
 
 
459 aa  895    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  100 
 
 
459 aa  944    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1165  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.35 
 
 
477 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.243116  hitchhiker  0.00329602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0545  arginine utilization regulatory protein RocR  41.45 
 
 
467 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.660554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1848  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.82 
 
 
424 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0545  arginine utilization regulatory protein RocR  40.13 
 
 
467 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000949535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0324  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.55 
 
 
487 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0464  arginine utilization regulatory protein RocR  41.01 
 
 
467 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0403  arginine utilization regulatory protein  39.91 
 
 
467 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0489  arginine utilization regulatory protein RocR  41.01 
 
 
467 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0407  arginine utilization regulatory protein  40.57 
 
 
467 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00327881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0494  arginine utilization regulatory protein RocR  40.57 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0207155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0409  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.7 
 
 
467 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4828  arginine utilization regulatory protein RocR  40.66 
 
 
467 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00181095  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1727  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.92 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0580  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.74 
 
 
494 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2712  putative regulatory protein  36.19 
 
 
475 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2603  putative regulatory protein  36.19 
 
 
475 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2549  putative regulatory protein  36.13 
 
 
475 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2591  putative regulatory protein  36.55 
 
 
475 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.43464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2503  putative regulatory protein  36.61 
 
 
475 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.69 
 
 
575 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0314  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.69 
 
 
449 aa  312  9e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.48 
 
 
581 aa  302  9e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48830  putative transcriptional regulator  37.15 
 
 
466 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000733273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4182  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
466 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00321886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.59 
 
 
585 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.06 
 
 
564 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  39.82 
 
 
662 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.05 
 
 
455 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1802  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.69 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0135454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.16 
 
 
687 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0978  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.32 
 
 
512 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.86 
 
 
454 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1041  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.78 
 
 
457 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.65 
 
 
582 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2710  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.13 
 
 
579 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  36.3 
 
 
668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  45.25 
 
 
549 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.33 
 
 
591 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.9 
 
 
459 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  43.99 
 
 
507 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.65 
 
 
688 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1625  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  45.07 
 
 
544 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0165781  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  35.87 
 
 
668 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  47.08 
 
 
542 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1683  transcriptional regulator  39.01 
 
 
588 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0451023  normal  0.0113335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.06 
 
 
592 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.69 
 
 
453 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2099  Fis family transcriptional regulator  40.87 
 
 
574 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.38 
 
 
453 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  45.69 
 
 
684 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0944  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.31 
 
 
480 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.16 
 
 
454 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  37.61 
 
 
600 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  38.44 
 
 
582 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1919  Fis family transcriptional regulator  44.59 
 
 
545 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.96 
 
 
495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0689  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.92 
 
 
544 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.430174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0456  hypothetical protein  37.66 
 
 
586 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0444  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.2 
 
 
482 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.11 
 
 
447 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.52 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1527  Fis family transcriptional regulator  46.39 
 
 
537 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 
703 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2305  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.53 
 
 
601 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.36 
 
 
461 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3238  putative PAS/PAC sensor protein  36.4 
 
 
624 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 
591 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.22 
 
 
655 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.07 
 
 
467 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.36 
 
 
461 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1840  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.56 
 
 
456 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  43.36 
 
 
461 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.36 
 
 
461 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.53 
 
 
468 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.8 
 
 
575 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  43.36 
 
 
461 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.36 
 
 
461 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1505  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.02 
 
 
522 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.034794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.71 
 
 
480 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5673  helix-turn-helix, Fis-type  42.42 
 
 
592 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1920  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.26 
 
 
543 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0127788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.39 
 
 
463 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.8 
 
 
448 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3598  proprionate catabolism activator, Fis family  36.24 
 
 
639 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00055082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.03 
 
 
544 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000701357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1492  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.02 
 
 
569 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2109  Fis family transcriptional regulator  41.88 
 
 
473 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.9 
 
 
483 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>