More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1192 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1192  NLP/P60 protein  100 
 
 		 365 aa  689    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.058782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  27.2 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.2 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.52 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  46.24 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  48.04 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  33.8 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  39.08 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  37.9 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  49.28 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  40.78 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  37.1 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.22 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  49.44 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.87 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  46.75 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.25 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  44.44 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.38 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.14 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  40.91 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  47.78 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  43.3 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 625 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  26.75 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.98 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  41.75 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.26 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  28.08 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  43.16 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0245  hypothetical protein  32.86 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  40.66 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  43 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  40.66 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  45.12 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  49.35 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.25 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.94 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  27.59 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  41.57 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  28.93 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  27.59 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.94 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.36 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  32.14 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  34.85 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.18 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  32.14 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  44.44 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  32.14 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>