109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0748 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  60.9 
 
 
304 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  60 
 
 
301 aa  325  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  49.83 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  47.62 
 
 
325 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  45.76 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  47.08 
 
 
298 aa  258  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  59.09 
 
 
76 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  31.41 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  28.7 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  37.74 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  36.89 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  26.67 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  26.56 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  37.5 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.32 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  27.89 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  27.2 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  36.11 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.77 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.51 
 
 
320 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.77 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  41.1 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.85 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.72 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.51 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  26.81 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  26.81 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  28.45 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.23 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  36.89 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
213 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.67 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  31.33 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  31.37 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02037  CipA proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKD1]  26.25 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  41.54 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  26.17 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 
317 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  33.6 
 
 
297 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
291 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03976  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05290)  26.86 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00351276  normal  0.162471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  37.33 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  34.65 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  33.02 
 
 
213 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  32.74 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  30.13 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  29.09 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  29.26 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  28.57 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  32.08 
 
 
215 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08060  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01630)  28.81 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19032  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  35.45 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  21.4 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  31.37 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  28.83 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  28.44 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  34.67 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  33.33 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  40.91 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.3 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  35.09 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.63 
 
 
491 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03993  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11770)  27.2 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  52.17 
 
 
493 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  29.25 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
228 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.63 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  38.03 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  38.39 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.68 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
358 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.82 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  31.86 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  31.9 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
223 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.79 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  24.69 
 
 
506 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  30.09 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2092  NmrA family protein  36.23 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.58 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  32.71 
 
 
901 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  32.2 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  32.52 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.26 
 
 
216 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>