54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5415 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  60 
 
 		 300 aa  346  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  54.11 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  45.7 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  47.08 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  41.75 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  42.66 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  58.46 
 
 		 76 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  28.69 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02037  CipA proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKD1]  33.06 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  32.18 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08060  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01630)  32.79 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19032  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03976  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05290)  27.59 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00351276  normal  0.162471 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  24.55 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  24.75 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  30.86 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  30.86 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  30.86 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.89 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  30.29 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  30.25 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  34.02 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  30.92 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  30.92 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  30.92 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  26.51 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  29.63 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  33.88 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  30.26 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  26.1 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  32.2 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  36.13 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  32.2 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  30.25 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  29.63 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  29.63 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.19 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.19 
 
 		 196 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11049  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.430438 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  29.93 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  30.39 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.25 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0987  NmrA family protein  31.96 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  29.88 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  37.62 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>