40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1731 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  100 
 
 
341 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  70.27 
 
 
325 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  45.76 
 
 
300 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  44.63 
 
 
304 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  41.75 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  39.02 
 
 
302 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  35.02 
 
 
298 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  28.29 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  38.94 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.8 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  39.68 
 
 
76 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  27.53 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  38.53 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  26.55 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  37.61 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  28.4 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  27.87 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  37.27 
 
 
328 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  34.51 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  22.94 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  22.94 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  32.2 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
355 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1791  NmrA family protein  29.02 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  28.65 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.17 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  33.94 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.99 
 
 
252 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03976  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05290)  40.98 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00351276  normal  0.162471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>