82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1973 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  100 
 
 		 302 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  49.83 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  49.66 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  45.39 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  47.08 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  39.41 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  39.02 
 
 		 341 aa  191  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  28.16 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.24 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  27.14 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.07 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03993  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11770)  29.77 
 
 		 198 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  27.09 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  23.29 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  26.48 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  36.52 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08968  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12510)  25.55 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547288  normal  0.861048 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  25.71 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  29.63 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  25.73 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  33.91 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.75 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  35.38 
 
 		 76 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  29.41 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  27.94 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  31.78 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  24.35 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.54 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.84 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  33.8 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  27.52 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  24.31 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  31.19 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 350 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04110  CIP1 protein, putative  22.22 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0184651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 573 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.5 
 
 		 477 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.75 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  23.28 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  23.28 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.25 
 
 		 477 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.75 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  29.63 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.18 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.2 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.93 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.88 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  29.01 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  31.62 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.77 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  31.13 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.98 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.08 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  25.59 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.01 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.63 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  34.11 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  23 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03976  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05290)  30.58 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00351276  normal  0.162471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  33.65 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  26.41 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  26.41 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  31.68 
 
 		 486 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  27.16 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  33.02 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.1 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  40 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  32.79 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  30 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  32.79 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>