26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6810 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  100 
 
 
317 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  98.11 
 
 
317 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  93.69 
 
 
317 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  91.77 
 
 
317 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  67.11 
 
 
313 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  57.65 
 
 
315 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  55.63 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  58.25 
 
 
312 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  47.84 
 
 
309 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  48.53 
 
 
309 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  40.72 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  41.04 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  40.72 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  40.72 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  40 
 
 
309 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  41.83 
 
 
280 aa  212  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  24.58 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32445  predicted protein  27.12 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.176138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  23.9 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  25.34 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  23.39 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  26.57 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60459  predicted protein  23.33 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.185541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  29.26 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  23.76 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  25.74 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>