24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2406 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  100 
 
 
313 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  66.45 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  67.11 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  66.67 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  64.8 
 
 
317 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  60.47 
 
 
312 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  58.47 
 
 
315 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  57.28 
 
 
310 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  48.5 
 
 
309 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  47.84 
 
 
309 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  42.95 
 
 
309 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  42 
 
 
309 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  42.62 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  42.28 
 
 
309 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  42.28 
 
 
309 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  44.95 
 
 
280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  25.68 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08968  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12510)  21.02 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547288  normal  0.861048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  23.77 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  26.42 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  26.97 
 
 
344 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  29.09 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  24.9 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  20.47 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>