26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4834 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  100 
 
 
317 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  98.11 
 
 
317 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  94.01 
 
 
317 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  92.09 
 
 
317 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  66.67 
 
 
313 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  57.98 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  55.63 
 
 
310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  58.9 
 
 
312 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  47.51 
 
 
309 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  48.21 
 
 
309 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  40.97 
 
 
309 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  41.29 
 
 
309 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  40.97 
 
 
309 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  40.97 
 
 
309 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  40.65 
 
 
309 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  41.1 
 
 
280 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  24.92 
 
 
359 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32445  predicted protein  27.12 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.176138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  24.91 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  25.34 
 
 
344 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60459  predicted protein  23.33 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.185541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  23.39 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  28.44 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  35.14 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  26.32 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  25.29 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>