110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5373 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  60.9 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  54.11 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  47.84 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  45.39 
 
 		 302 aa  262  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  44.63 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  45.15 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  29.15 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  53.97 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  28.4 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.68 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.06 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  28.63 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  26.25 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  25 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.33 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  26.72 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  27.71 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03993  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11770)  31.3 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.75 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  36.21 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  35.34 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  32.76 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  27.95 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  29.27 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  22.5 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  27.78 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  32.17 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.82 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  36.63 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  32.35 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.67 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.69 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  27.92 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  35.78 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11049  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.430438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.02 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.6 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  37.62 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  36.63 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  23.74 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  34.65 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0325  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.93 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00224359  hitchhiker  9.32819e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.33 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  44.87 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  26.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.53 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  26.56 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  31.9 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.47 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  34.21 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03976  isoflavone reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G05290)  28 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00351276  normal  0.162471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  24.9 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.64 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  25.74 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  27.9 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.1 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  28.97 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  37.88 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  35.51 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.9 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  24.89 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  22.73 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  22.73 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.71 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.87 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  32.74 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.75 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  38.36 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  31.2 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  55.56 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  55.56 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  34.26 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  22.98 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  32.89 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  55.56 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>