112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2857 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  100 
 
 		 325 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  70.27 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  47.84 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  47.62 
 
 		 300 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  45.7 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  39.54 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  38.8 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  25.95 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0115  hypothetical protein  47.69 
 
 		 76 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  26.58 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  26.54 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  40.37 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  29.63 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.84 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06668  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000106113  normal  0.0892727 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  26.88 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  29.45 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  23.38 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  25.74 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  30.26 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 482 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  36.04 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  24.89 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  24.89 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  29.19 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.7 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  31.48 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0325  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00224359  hitchhiker  9.32819e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.24 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  27.16 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  26.97 
 
 		 357 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  26.75 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  26.16 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.41 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28.4 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  37.5 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  35.19 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  26.34 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  27.24 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.84 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 		 218 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.88 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  35.78 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  34.55 
 
 		 216 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  27.43 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.07 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  24.89 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.24 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  28.39 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  28.31 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.42 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  26.81 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  30.56 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.62 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  36.54 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  27.71 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.38 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  35.51 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.95 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.85 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.31 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  27.89 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00302715  hitchhiker  0.000000109049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>