42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3603 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3603  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2749  NmrA family protein  32.83 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5373  NmrA family protein  29.15 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0748  NmrA family protein  31.41 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.461727  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08815  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  30.19 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1973  NmrA family protein  29.3 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0361204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5415  NmrA family protein  29.57 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.958636  normal  0.0224555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2857  NmrA family protein  25.95 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  26.75 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1731  NmrA family protein  33.33 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  25.53 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02037  CipA proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NKD1]  25.31 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08354  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00230)  30.63 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  25 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  26.14 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  23.77 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5615  NmrA family protein  33.33 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.343822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.42 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  30.28 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  25.12 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  22.74 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 203 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.13 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  22.35 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3848  NmrA family protein  33.07 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.998824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60535  predicted protein  21.46 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  30.82 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1991  sugar nucleotide epimerase  35.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.971657  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.62 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  34.29 
 
 		 204 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  31.06 
 
 		 218 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.57 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  32.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  26.9 
 
 		 218 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.97 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>