88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0127 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 237 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  44.59 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.92 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.8 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.7 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.75 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.93 
 
 		 734 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  42.29 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.06 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  25.33 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.9 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.45 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.52 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.18 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.24 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.97 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.36 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  43.7 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  43.7 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.61 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  32.91 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.78 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  31.75 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  33.51 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.32 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.97 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  31.54 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  29.1 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  28.51 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.74 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.74 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.93 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  26.2 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  28.05 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  18.61 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.92 
 
 		 508 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0177  uroporphyrinogen-III synthase  26.83 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.86 
 
 		 510 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.36 
 
 		 567 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  27.16 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  27.16 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  27.16 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3988  uroporphyrinogen-III synthase  27.76 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  28.64 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  24.78 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  31.72 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.36 
 
 		 527 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  23.15 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  27.86 
 
 		 565 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  26.87 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.62 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.36 
 
 		 577 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.36 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.36 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.36 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.89 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.36 
 
 		 571 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.08 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.08 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  25.98 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  26.67 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  26.1 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  26.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  23.21 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  25.7 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  25.4 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  25.4 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  25.4 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  25.7 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  25.4 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  25.4 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  25.49 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.86 
 
 		 516 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  25.99 
 
 		 505 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  32.91 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  22.77 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  22.37 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  22.37 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  22.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.44 
 
 		 260 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.18 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  26 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>