39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4324 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.8 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  33.2 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.79 
 
 		 734 aa  95.1  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  26.38 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  23.38 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.83 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.86 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.63 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.62 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.84 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.51 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.56 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.28 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.91 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.8 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.74 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.39 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  25.86 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.92 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.47 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.96 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  27.35 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  28.86 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.83 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.4 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  26.25 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  29.22 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.97 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  34.31 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  34.31 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  24.71 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.04 
 
 		 520 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  28.93 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  26.05 
 
 		 558 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.31 
 
 		 238 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>