62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3700 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  81.28 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  43.28 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  46.44 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  34.15 
 
 		 244 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  35.02 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  35.02 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.16 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.77 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.43 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.71 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.4 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  33.88 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.2 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  35.54 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.15 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.66 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.37 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.15 
 
 		 734 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  34.02 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.63 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  29.27 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.32 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.63 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.71 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.82 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.8 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.23 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.14 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.88 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.76 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.66 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.13 
 
 		 607 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.44 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.38 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  26.7 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.69 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.08 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.78 
 
 		 516 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.71 
 
 		 604 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  29.41 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  28.22 
 
 		 565 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.74 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.43 
 
 		 526 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.19 
 
 		 527 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4370  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.5 
 
 		 562 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.23 
 
 		 571 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.43 
 
 		 526 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.26 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.16 
 
 		 510 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.72 
 
 		 567 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  29.61 
 
 		 558 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.72 
 
 		 577 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.09 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.73 
 
 		 554 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.11 
 
 		 672 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.73 
 
 		 554 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.73 
 
 		 554 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  23.11 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.73 
 
 		 569 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>