20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1477 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.94 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  33.5 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.5 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.48 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  24.66 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  26.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.88 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  29.24 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.47 
 
 		 528 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  28.22 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.08 
 
 		 490 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  22.78 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.9 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  28.66 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59732  Uroporphyrinogen-III synthase (UROS) (Uroporphyrinogen-III cosynthetase) (Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]) (UROIIIS)  26.02 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851052  hitchhiker  0.00718151 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44610  uroporphyrinogen-iii synthase  25.47 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  28.31 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  24.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>