26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1262 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  51.2 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  49.76 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  47.37 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.13 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  38.94 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  38.94 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  37.5 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  35.94 
 
 		 302 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  32.24 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  29.69 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  32.94 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.35 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.94 
 
 		 491 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.38 
 
 		 490 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.85 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.68 
 
 		 513 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.78 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44610  uroporphyrinogen-iii synthase  24.64 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.20099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  26.56 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.2 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  26.99 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  24.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.74 
 
 		 520 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.43 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.12 
 
 		 497 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>