40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1223 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  95.69 
 
 		 209 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  95.22 
 
 		 209 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  53.11 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  39.15 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  41.83 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  38.94 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  37.74 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.44 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  34.6 
 
 		 302 aa  95.9  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  34.08 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.55 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  25.52 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.22 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  35.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  35.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  29.17 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  44.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  28.12 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  27.6 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  26.85 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  27.52 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  31.18 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  27.12 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0113  uroporphyrinogen III methylase  32.2 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  27.75 
 
 		 526 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  24.87 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  24.35 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.43 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  26.67 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  24.52 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.36 
 
 		 248 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.96 
 
 		 265 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  32.58 
 
 		 526 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.7 
 
 		 248 aa  41.2  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>