25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0948 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
214 aa  434  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  57.94 
 
 
212 aa  247  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  49.76 
 
 
211 aa  204  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  46.63 
 
 
211 aa  175  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.95 
 
 
214 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  39.9 
 
 
302 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  39.15 
 
 
209 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  40.1 
 
 
212 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  38.68 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  39.15 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  29.95 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  31.97 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  28.02 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.46 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.63 
 
 
513 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  31.18 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.23 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.6 
 
 
490 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.46 
 
 
497 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  32.81 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.49 
 
 
493 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  24.84 
 
 
526 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.56 
 
 
512 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>