58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0596 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  36.59 
 
 		 302 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  40.95 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  39.71 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  34.13 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  37.98 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  37.91 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  37.44 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  33.01 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  37.67 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  30.81 
 
 		 212 aa  98.2  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.72 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.74 
 
 		 513 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  34.9 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.93 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.62 
 
 		 503 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  32.05 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.41 
 
 		 511 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  28.1 
 
 		 526 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  32.65 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  32.65 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  31.41 
 
 		 516 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.03 
 
 		 512 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.92 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  31.97 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.68 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  31.25 
 
 		 526 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  31.97 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01291  putative uroporphyrinogen III synthase  25.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.414645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.34 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.29 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  29.17 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.77 
 
 		 520 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  30.14 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  30.61 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  30.61 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  25.15 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0272  uroporphyrinogen-III synthase  24.62 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  29.05 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  23.67 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.33 
 
 		 509 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.9 
 
 		 503 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  29.55 
 
 		 526 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.55 
 
 		 522 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.98 
 
 		 526 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25 
 
 		 517 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.27 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.76 
 
 		 546 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.41 
 
 		 512 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.14 
 
 		 506 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.5 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.66 
 
 		 502 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.25 
 
 		 516 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.25 
 
 		 579 aa  42  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.36 
 
 		 507 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.16 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  25.15 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  24.29 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>