19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0202 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  50.81 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.72 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.15 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  50.41 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.52 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.56 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  45.68 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.08 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.73 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  26.13 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.89 
 
 		 526 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.89 
 
 		 526 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  27.06 
 
 		 492 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.36 
 
 		 594 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  38.04 
 
 		 513 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  27.03 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  24.27 
 
 		 290 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0640  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.63 
 
 		 228 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>