35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1228 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.59 
 
 		 214 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  39.9 
 
 		 214 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  38.46 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  35.94 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  37.84 
 
 		 211 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  35.55 
 
 		 209 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  31.63 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  34.6 
 
 		 209 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  35.38 
 
 		 209 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  32.66 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  29.59 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.13 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  28.44 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  28.44 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  32.79 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  28 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  31.73 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  30.21 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  27.68 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1233  uroporphyrinogen-III synthase  30.6 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0133688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  26.85 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  26.39 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  26.85 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.21 
 
 		 493 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.3 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.91 
 
 		 506 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.19 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  24.07 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1399  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.8 
 
 		 226 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.35 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  29.27 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.17 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  26.19 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>