30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0480 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  77.63 
 
 
240 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  43.29 
 
 
235 aa  185  5e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.89 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  23.38 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.44 
 
 
734 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.69 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.85 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.51 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.43 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  22.03 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.85 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  23.31 
 
 
235 aa  62  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  23.31 
 
 
235 aa  62  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.91 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.57 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.85 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  22.95 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  24.68 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  23.96 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 
235 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  22.31 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  20.65 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  25.2 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  22.27 
 
 
232 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  21.65 
 
 
238 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  27.59 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  21.72 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  26.19 
 
 
302 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>