41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1937 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 229 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  37.39 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  32.48 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  31.71 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  31.71 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  37.43 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.71 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.19 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.6 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.51 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.71 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  31.32 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.32 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  32.91 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.78 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.5 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  20.44 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.2 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.62 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.35 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.33 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.58 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.99 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.23 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  30.6 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  29.79 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.94 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  26.61 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  28.18 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.65 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.83 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  32.98 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.33 
 
 		 734 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.15 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  35.71 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.58 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.4 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.34 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  30.09 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>