56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0288 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  62.55 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  61.73 
 
 		 265 aa  287  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.91 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  61.07 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  59.84 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.79 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.76 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.6 
 
 		 734 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.93 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.97 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.83 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  33.2 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  34.41 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  34.41 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.22 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.63 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.63 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.88 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.88 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  34.01 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  34.01 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  33.75 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  32.79 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.5 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.21 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.86 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.92 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.1 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.03 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.93 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.98 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  32.49 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.5 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.61 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  28.43 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  29.76 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  26.72 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  40.15 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  44.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.65 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.01 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  36.54 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  36.54 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  36.54 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.27 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  30.69 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.8 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  29.7 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.71 
 
 		 243 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.64 
 
 		 246 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  31.8 
 
 		 255 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  24.62 
 
 		 246 aa  41.6  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>