59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0314 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  88.26 
 
 		 247 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  82.19 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  65.32 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.08 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  61.73 
 
 		 245 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.44 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.02 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 734 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  34.16 
 
 		 235 aa  99.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  34.16 
 
 		 235 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.29 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.63 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.39 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.89 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.48 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.2 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  25.21 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.89 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  33.47 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.06 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  31.8 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  33.88 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.8 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.53 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  30.96 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.36 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.88 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  21.43 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  29.51 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  28.4 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.3 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  26.37 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.91 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.97 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  30.96 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  35.61 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  27.82 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  26.72 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  27.97 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  36.22 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  29.02 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  30.41 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.45 
 
 		 526 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.45 
 
 		 526 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.44 
 
 		 528 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  28.25 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  27.62 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  28.25 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.33 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  32 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  41.18 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.27 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.78 
 
 		 267 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>