38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0706 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 242 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  84.81 
 
 		 236 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  86.5 
 
 		 236 aa  338  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.79 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  56.07 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.3 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.93 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.78 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  38.68 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.8 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.78 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.95 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.7 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.76 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.48 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.89 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  34.43 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.27 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  33.46 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.88 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.78 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  30.9 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.73 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.76 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.46 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.02 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  35 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  32.54 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.22 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  33.51 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.9 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  32.71 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  29.92 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>