76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1159 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 232 aa  453  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.92 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.56 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.56 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.66 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.85 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.71 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.98 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.83 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.08 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.96 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.19 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.87 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.77 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  36.97 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.4 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.59 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.6 
 
 		 734 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  34.71 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  34.71 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.06 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  25.48 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  33.62 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  30.96 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  31.36 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.27 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  33.88 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  33.2 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.51 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.78 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.17 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  28.39 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.99 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  36.18 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  32.85 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.9 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.88 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.37 
 
 		 516 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.29 
 
 		 503 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.66 
 
 		 520 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.71 
 
 		 508 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.09 
 
 		 511 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.5 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.94 
 
 		 512 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.72 
 
 		 503 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  27.42 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.82 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.5 
 
 		 522 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.91 
 
 		 511 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  27.02 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  22.94 
 
 		 505 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  37.78 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  40.74 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.6 
 
 		 502 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.1 
 
 		 512 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  24.06 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.64 
 
 		 510 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  30 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.07 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  29.63 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  27.03 
 
 		 250 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.55 
 
 		 245 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  30.05 
 
 		 515 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.79 
 
 		 249 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  28.19 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.56 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.65 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>