48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0563 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  83.47 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  61.73 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.82 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  60.08 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.87 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  59.84 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.56 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  37.25 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  37.25 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.66 
 
 		 734 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.17 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.51 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  35 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.2 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.21 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.5 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.63 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.27 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.06 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.1 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.86 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.48 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  34.03 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  31.56 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  32.88 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.85 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  29.96 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  35.2 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.06 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.74 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  19.57 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  18.29 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  27.17 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  30.95 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.83 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  29.07 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  31.96 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  28.46 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.1 
 
 		 520 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.9 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  25.2 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  35.67 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.622728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.18 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  25.58 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  28.83 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>