37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2967 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  46.44 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  41.77 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  39.92 
 
 		 238 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  36.02 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  35.83 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  35.83 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.2 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.39 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.36 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.33 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  33.47 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.88 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.2 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  31.56 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.55 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.4 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.65 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  21.65 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.1 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.32 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.49 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.08 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.38 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.79 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.46 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  24.71 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.9 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  29.81 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.15 
 
 		 672 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.45 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.77 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.87 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.96 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.22 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>