44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0119 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.08 
 
 		 734 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.51 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.06 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  26.16 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  33.2 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  33.2 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  35.37 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  34.44 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.48 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.01 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.3 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.8 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  31.98 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.3 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  32.26 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.12 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.43 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.74 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  32.35 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  19.91 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.12 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.63 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  29.83 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.63 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  24.38 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.32 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.59 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  30.29 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.87 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.48 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  30.33 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.03 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2913  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.155433 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.68 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0516  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.32 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.655378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.41 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1244  uroporphyrinogen-III synthase  24.39 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25.87 
 
 		 516 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.45 
 
 		 494 aa  42.4  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.655247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.51 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.02 
 
 		 242 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.04 
 
 		 224 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.39 
 
 		 492 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>