53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1000 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  43.29 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.45 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.74 
 
 		 734 aa  104  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.35 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.25 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  26.38 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.21 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.69 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.72 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.16 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.79 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.48 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  22.5 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.12 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  24.14 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.1 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.73 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.83 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.74 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  31.97 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.05 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  25.22 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.93 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.5 
 
 		 505 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  27.63 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  26.02 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  26.02 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.51 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  30.77 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2913  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.9 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.155433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  28.93 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.5 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.47 
 
 		 512 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 520 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  22.4 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.8 
 
 		 512 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  19.49 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  31.48 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  22.5 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  29.27 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.34 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  23.53 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.07 
 
 		 510 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  22.32 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  23.51 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  30.56 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.42 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  24.23 
 
 		 247 aa  42  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.76 
 
 		 238 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>