24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1121 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 212 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  54.55 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  53.11 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  53.11 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  40.1 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  35.38 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  32.24 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  31.94 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.81 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  31.63 
 
 		 302 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  31.58 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  35.59 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.77 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.77 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  26.25 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  27.59 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  28.89 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.2 
 
 		 490 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.58 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  25.69 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  24.44 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  23.04 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  25.61 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>