41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1098 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
209 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  95.69 
 
 
209 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  94.26 
 
 
209 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  53.11 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  38.68 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  41.35 
 
 
211 aa  129  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  38.94 
 
 
211 aa  124  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  38.21 
 
 
212 aa  121  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.91 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  35.55 
 
 
302 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  32.2 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1199  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.73 
 
 
491 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  26.04 
 
 
252 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  27.1 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  27.1 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  27.1 
 
 
250 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.24 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  29.23 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  28.12 
 
 
250 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  29.17 
 
 
250 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  27.89 
 
 
272 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  26.17 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  32.81 
 
 
235 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  32.81 
 
 
235 aa  45.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  31.48 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  27.12 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  29.89 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  25.83 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0113  uroporphyrinogen III methylase  31.36 
 
 
264 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  26.64 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  26.64 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.44 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  25.77 
 
 
249 aa  42.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  23.53 
 
 
526 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32 
 
 
265 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  23.2 
 
 
276 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.57 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  28.7 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  26.62 
 
 
235 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.32 
 
 
266 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>