40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0976 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  72.34 
 
 
235 aa  338  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  72.34 
 
 
235 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  39.08 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  36.02 
 
 
238 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  34.16 
 
 
235 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.16 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 
238 aa  89  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.34 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.8 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.96 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.59 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.05 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.74 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  30.13 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  32.81 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.25 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.98 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.24 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.29 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.74 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.95 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.74 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.47 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.37 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2787  uroporphyrinogen-III synthase  28.39 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2877  uroporphyrinogen-III synthase  33.1 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.28 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  27.5 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  25.83 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.07 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  32.81 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.47 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  26.98 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  26.67 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.75 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3476  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.82 
 
 
270 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>