35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4146 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  43.28 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  42.44 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  39.92 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  33.76 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  30.96 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  30.96 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.39 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.01 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.3 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.3 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.79 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.33 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.86 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.36 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.82 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.93 
 
 		 734 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.49 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.96 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.29 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.47 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.88 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.91 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.48 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  22.31 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.49 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.08 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.75 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.98 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  29.41 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  23.78 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.07 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.99 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.21 
 
 		 262 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>