56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3567 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 734 aa  1414    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.99 
 
 		 237 aa  166  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.63 
 
 		 245 aa  121  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.08 
 
 		 234 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  29.74 
 
 		 235 aa  104  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.6 
 
 		 245 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.05 
 
 		 265 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.02 
 
 		 248 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.66 
 
 		 248 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  29.79 
 
 		 246 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.38 
 
 		 247 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.55 
 
 		 248 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.6 
 
 		 232 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0480  uroporphyrinogen-III synthase  25.44 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  36.48 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.46 
 
 		 240 aa  83.6  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.61 
 
 		 248 aa  84  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  42.18 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  30.55 
 
 		 461 aa  72  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  34.03 
 
 		 232 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  31.15 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.62 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 236 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.19 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.93 
 
 		 236 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  35.03 
 
 		 238 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.31 
 
 		 245 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.62 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.98 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.19 
 
 		 242 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0441  hypothetical protein  25.43 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.964124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.51 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2913  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.93 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.155433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  33.09 
 
 		 313 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  28.93 
 
 		 238 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.17 
 
 		 238 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  29.07 
 
 		 428 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  27.73 
 
 		 478 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  27.69 
 
 		 462 aa  52.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  26.8 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.86 
 
 		 520 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.51 
 
 		 224 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  28.4 
 
 		 235 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  29.32 
 
 		 238 aa  48.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0042  hypothetical protein  27.11 
 
 		 437 aa  48.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05310  mitochondrion protein, putative  32.24 
 
 		 725 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  22.16 
 
 		 526 aa  47.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  32.98 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  32.98 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  26.11 
 
 		 251 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  26.29 
 
 		 249 aa  45.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.12 
 
 		 260 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  33.61 
 
 		 266 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.47 
 
 		 510 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>