19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0120 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.25 
 
 
734 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  33.54 
 
 
478 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.41 
 
 
461 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  31.37 
 
 
462 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  32.67 
 
 
431 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  27.94 
 
 
428 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  25.5 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  25.41 
 
 
478 aa  54.3  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  36.57 
 
 
429 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  34.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  32.12 
 
 
768 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  32.37 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1996  hypothetical protein  37.5 
 
 
523 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00622478  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  31.09 
 
 
762 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  32.26 
 
 
776 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  27.84 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  27.84 
 
 
458 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  27.84 
 
 
452 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>