16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2912 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  75.17 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  75.17 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3417  hypothetical protein  35.4 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4082  hypothetical protein  48.05 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2827  hypothetical protein  34.52 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  29.47 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  28.9 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  27.01 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  30.4 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  37.23 
 
 		 313 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  27.9 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.41 
 
 		 734 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  27.82 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  31.29 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  27.59 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>