18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1885 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  899    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  99.78 
 
 
458 aa  895    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  71.64 
 
 
452 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  31.54 
 
 
478 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  33.94 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  33.03 
 
 
428 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  33.8 
 
 
461 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  32.4 
 
 
462 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  26.35 
 
 
478 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  32.24 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  28.77 
 
 
768 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0748  hypothetical protein  28.77 
 
 
762 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  28.67 
 
 
776 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  27.67 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0287  hypothetical protein  28.75 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  32.54 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  32.54 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05310  mitochondrion protein, putative  26.28 
 
 
725 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>