15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0159 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6207  hypothetical protein  99.77 
 
 		 433 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2912  hypothetical protein  75.63 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0303561  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3417  hypothetical protein  33.96 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4082  hypothetical protein  37.61 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2827  hypothetical protein  33.24 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  30.21 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  28.41 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  30.57 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  28.13 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  28.37 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  28.84 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  35.34 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.6 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>